วิวัฒนาการของจุลินทรีย์ในลำไส้กับโฮสต์ของมนุษย์
จุลินทรีย์หลายชนิดในลำไส้ของมนุษย์สามารถพบได้ในประชากรจากทั่วทุกมุมโลก ภายในสปีชีส์ของจุลชีพ สายพันธุ์ของจุลชีพมีความแตกต่างกันอย่างน่าทึ่งระหว่างบุคคลและประชากร แม้จะมีความสำคัญต่อสุขภาพของมนุษย์ แต่ก็ยังไม่ค่อยมีใครรู้จักต้นกำเนิดของสายพันธุ์เหล่านี้ สายพันธุ์เหล่านี้ส่วนใหญ่อาศัยอยู่เฉพาะในลำไส้ของมนุษย์เท่านั้น